BACKGROUND AND OBJECTIVES: With an increased demand for rapid, diagnostic tools for TB and drug resistance detection, Truenat® MTB-RIF assay has proven to be a rapid point of care molecular test. The present study aimed to establish a proof of concept of using Trueprep-extracted DNA for line-probe assay (LPA) testing.METHODS: A total of 150 sputum samples (MTB-positive at Truenat sites) were divided into two aliquots. One aliquot was used for DNA extraction using the Trueprep device and MTB testing. The second aliquot of the sample was subjected to GenoLyse® DNA extraction. DNA from both the Trueprep and GenoLyse methods was subjected to first-line (FL) and second-line (SL) LPA testing.RESULTS: Of 139 Trueprep-extracted DNA, respectively 135 (97%) and 105 (75%) had interpretable results by FL and SL-LPA testing. Of 128 GenoLyse-extracted DNA, all 128 (100%) had interpretable FL-LPA results and 114 (89%) had interpretable SL-LPA results.CONCLUSION: The results obtained in this study indicate that Trueprep-extracted DNA can be used in obtaining valid LPA results. However, the study needs to be conducted on a larger sample size before our recommendations can be used for policy-making decisions.
CONTEXTE ET OBJECTIFS :: Face à la demande croissante d’outils de diagnostic rapide pour la TB et la détection de la résistance aux médicaments, le test Truenat® MTB-RIF s’est avéré être un test moléculaire rapide sur le lieu de soins. La présente étude visait à établir une preuve de concept de l’utilisation de l’ADN extrait de Trueprep pour le test de la sonde de ligne (LPA, de l’anglais ‘line-probe assay’).
MÉTHODES :: Un total de 150 échantillons d’expectoration (MTB-positifs dans les sites Truenat) ont été divisés en deux aliquotes. Une aliquote a été utilisée pour l’extraction de l’ADN à l’aide du dispositif Trueprep et pour le test MTB. La seconde aliquote de l'échantillon a été soumise à l’extraction d’ADN par GenoLyse®. L’ADN issu des méthodes Trueprep et GenoLyse a été soumis à un test de LPA de première ligne (FL, de l’anglais ‘first-line’) et de deuxième ligne (SL, de l’anglais ‘second-line’).
RÉSULTATS :: Sur 139 ADN extraits par la méthode Trueprep, 135 (97%) et 105 (75%) respectivement ont donné des résultats interprétables par les tests FL- et SL-LPA. Sur 128 ADN extraits par GenoLyse, les 128 (100%) ont obtenu des résultats interprétables par FL-LPA et 114 (89%) ont obtenu des résultats interprétables par SL-LPA.
CONCLUSION :: Les résultats obtenus dans cette étude indiquent que l’ADN extrait par Trueprep peut être utilisé pour obtenir des résultats de LPA valides. Cependant, l'étude doit être menée sur un échantillon plus important avant que nos recommandations puissent être utilisées pour des décisions politiques.